新生儿真菌感染要治多久，需根据宝宝的身体素质以及症状的严重程度进行分析，但一般通常在20~30天左右。
如果新生儿的身体素质相对较好，受到真菌感染的程度也比较轻，并未有过多的不良症状产生，通常治疗需要的时间就会比较短，一般在20天左右就能够得到改善。但若是新生儿的身体素质本就较差，受到真菌感染的程度也比较深，则治疗需要的时间也会较久，至少需要30天左右。
在发现新生儿患有真菌感染时，一般需要及时对饮食进行调整，避免进食过于辛辣、刺激的食物，饮食尽量以清淡、易消化为主。同时还要及时就医，在医生指导下根据新生儿的具体情况选择伊曲康唑，或是特比萘芬等抗真菌的药物进行针对性治疗，就能使症状得到一定程度的改善。